Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top6blJ3QMY9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top6blJ3QMY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top6blJ3QMY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms