Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20830J3KML6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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