Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29394H3BIW7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms