Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b1G5E829 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b1G5E829 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b1G5E829 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms