Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r76F8VQ63 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r76F8VQ63 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms