Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Farp1F8VPU2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Farp1F8VPU2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms