Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5160F8VPN3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5160F8VPN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms