Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm5798F7BTS7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm5798F7BTS7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5798F7BTS7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5798F7BTS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms