Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20538F6Z9R1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20538F6Z9R1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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