Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21970F6XX07 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms