Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Crocc2F6XLV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Crocc2F6XLV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Crocc2F6XLV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Crocc2F6XLV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Crocc2F6XLV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms