Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc149F6V035 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc149F6V035 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc149F6V035 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms