Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm28305F6U473 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms