Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3072F6SKY8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms