Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd7E9Q9W7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd7E9Q9W7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdzd7E9Q9W7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms