Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A430078G23RikE9Q7Y4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A430078G23RikE9Q7Y4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A430078G23RikE9Q7Y4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A430078G23RikE9Q7Y4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms