Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ApobE9Q414 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApobE9Q414 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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