Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcc4E9Q236 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcc4E9Q236 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcc4E9Q236 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcc4E9Q236 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc4E9Q236 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Abcc4E9Q236 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcc4E9Q236 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms