Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
NebE9Q1W3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms