Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt78E9Q0F0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt78E9Q0F0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt78E9Q0F0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt78E9Q0F0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms