Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx60E9PZQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx60E9PZQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx60E9PZQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms