Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph10bE9PYQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph10bE9PYQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph10bE9PYQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms