Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmo7E9PYF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmo7E9PYF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmo7E9PYF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmo7E9PYF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmo7E9PYF4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms