Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54bE9PXC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms