Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rsf1E9PWW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rsf1E9PWW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rsf1E9PWW9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Rsf1E9PWW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Rsf1E9PWW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rsf1E9PWW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms