Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim30dE9PWL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim30dE9PWL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim30dE9PWL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30dE9PWL0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms