Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cngb1E1AZ71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cngb1E1AZ71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cngb1E1AZ71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Cngb1E1AZ71 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms