Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx8D3YU81 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx8D3YU81 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms