Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A930018M24RikB7ZMY3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A930018M24RikB7ZMY3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A930018M24RikB7ZMY3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms