Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia1B2RXQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia1B2RXQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia1B2RXQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms