Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
Abcc8B2RUS7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abcc8B2RUS7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Abcc8B2RUS7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Abcc8B2RUS7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Abcc8B2RUS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Abcc8B2RUS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1317.3 ms