Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf3B2RQG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf3B2RQG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms