Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930435E12RikA6X8Z9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930435E12RikA6X8Z9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms