Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbp4A4UUI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4A4UUI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp4A4UUI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp4A4UUI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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