Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms