Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn3aA2ASI5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn3aA2ASI5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn3aA2ASI5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms