Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SktA2AQ25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SktA2AQ25 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SktA2AQ25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SktA2AQ25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms