Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GabreA2AMW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GabreA2AMW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GabreA2AMW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms