Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn3A2ALK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn3A2ALK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn3A2ALK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms