Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prdm12A2AJ77 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm12A2AJ77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm12A2AJ77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm12A2AJ77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms