Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam171a2A2A699 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam171a2A2A699 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam171a2A2A699 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms