Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Akap17bA2A3V1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Akap17bA2A3V1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Akap17bA2A3V1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akap17bA2A3V1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms