Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc173A0JLY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc173A0JLY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms