Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms