Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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