Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-42A0A0A6YY38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Ighv1-42A0A0A6YY38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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