Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms