Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC034090A0A087WP46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC034090A0A087WP46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms