Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrit3W8DXL4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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