Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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